五島健助（吉岡秀隆飾演）原本是眾所公認、前途無量的優秀醫師，因為發生某個事件，而毅然決然告別女友（石田百合子飾演），志願千里迢迢從東京來到沒有醫師、缺乏醫療環境的南海孤島－志木那島。
　　由於離島醫師一向流動性很大，因此居民們多半對他採取懷疑而不友善的態度。即使如此，五島醫師仍本著以生命為尊的信念，與同樣充滿正義感的護士彩佳（柴崎幸飾演），在有限的資源下灌注熱情，兩人三腳共同面對一切病魔！
　　「小孤島大醫生」改編自第49回小學館漫畫賞作品，在日本播出時平均收視率高達18.9﹪，最終回更一路飆升到22.3﹪，輕鬆榮登2003年日劇暑假檔冠軍寶座！而劇中虛構的志木那島外景部分，則選擇在日本最西邊、距台灣僅111公里遠的沖繩與那國島拍攝。美麗未受污染的海洋與珊瑚礁、島上純樸濃厚的人情味，均完整呈現在「小孤島大醫生」當中。
　　至於全劇靈魂人物，則分別請到「來自北國」的吉岡秀隆，以及「從天而降億萬顆星星」「鬼來電」新生代女星柴崎幸詮釋男女主角；同時搭配大塚寧寧、石田百合子、筧利夫、小林薰…等實力派演員，讓表演層次更加豐富。而中島美雪深具畫龍點睛效果的主題曲，也增添了「小孤島大醫生」平實中散發溫暖光芒的感動，值得仔細傾聽。